здравствуйте.

Возможно Вы удалили их в корзину.

ПРосмотрите корзину в файловом менеджере.

Уточнит путь к папке, мы проверим и сообщим дату бэкапа.

уточните пожалуйста какой файл вы ищите

Вот все что есть в бекапе.

sarosoco# ls

**                   carsell.com.ua        digitalmarketer.world  inbound.host       marketingprof.site  socialmediatoday.host

PublishAPI           conversionrate.pro    elasticwage.com        logs               marketo.host        ssl

access-logs          convertkit.host       etc                    mail               optimizely.host     tmp

attentivewealth.com  copyblogger.club      getinstacall.com       mailshift.co       public_ftp          www

cache                digitalmarketer.host  growthhacker.pw        marketingblog.pro  public_html

в бекапе только файл index.php, он восстановлен